단백질 구조 도메인 주석을위한 레거시 소프트웨어 재 포장 : ASSS 바카라사이트 안내

ARC는 기존 생물 정보학 데이터 파이프 라인을보다 휴대하고 확장 가능하며 거대한 새로운 데이터 세트에 적용 할 준비가되도록 바카라사이트 안내에서 Orengo Group (UCL 구조 및 분자 생물학)과 협력했습니다.

그림 1 (위) 개요cath분류 파이프 라인.

배경

10587_11488

우리가 한 일

ORENGO 그룹11613_12109Dr Ian Sillitoe바카라사이트 안내 SMB의 ORENGO 그룹에서 기존 레거시 코드를 휴대용 모듈로 분리하여 현대적이고 잘 테스트 된 워크 플로우 관리 프레임 워크 (NextFlow)를 사용하여 이러한 모듈을 함께 접착시키는 것 외에도 독립적 인 작업 단위로 실행할 수있는 휴대용 모듈로 분리합니다. 이를 통해 바카라사이트 안내의 HPC 시설 내에서 이러한 데이터 파이프 라인을 쉽게 채택 할 수있는 유연성과 이식성을 제공합니다.

영향

주요 작품은 이것의 일부로 달성되었습니다오픈 소스 소프트웨어 지속 가능성 (OSS) 자금 지원 바카라사이트 안내는 ARC 및 컴퓨터 과학에서 HPC 시설에서 기본적으로 실행할 수있는 NextFlow 데이터 파이프 라인을 구축하여 구성을 최소화했습니다. 또한, 기존 차세대 플로우 스크립트는 권장 모범 사례의 패턴을 고려하기 위해 리팩토링되었습니다. 이를 통해 스크립트를보다 관리하기 쉽고 향후 확장하기 쉽고 커뮤니티와 쉽게 공유 할 수 있도록 도와주었습니다. 이 바카라사이트 안내는 여전히 활발한 개발 중이며 Github에서 사용할 수 있습니다 [2].

링크

[1]13498_13523

[2]https : //github.com/바카라사이트 안내orengogroup/cath-alphaflow

---