인턴쉽 영향 요약 : 건강 스피드 바카라 사이트 과학 흑인 인턴쉽 ARC & HDR UK

Ditso Tirelo의 프로젝트는 기계 학습을 사용하여 TP53 돌연변이를 스피드 바카라 사이트하고 주요 핫스팟 (예 : 282, 245) 및 암에 대한 링크를 찾았습니다. 이 스피드 바카라 사이트는 미래의 스피드 바카라 사이트를위한 통찰력과 토대를 제공합니다.

배경

여름에 ARC는 스피드 바카라 사이트 Ditso Tirelo를 호스팅하여Health Data Research UK (HDRUK)로 스피드 바카라 사이트 프로젝트를 완료하려면Dr Benjamin HallUCL 의료 물리학 및 생물 의학 공학부. Hall 박사의 스피드 바카라 사이트 관심사는 의료 분야의 암 이해를 알리기 위해 세포의 돌연변이가 신체에 어떤 영향을 줄 수 있는지 조사하기 위해 계산 생물학을 활용합니다. Ditso의 프로젝트는에 의해 수행 된 이전 스피드 바카라 사이트를 기반으로했습니다.Hall Lab, 기계 학습을 사용하여 TP53 유전자를 탐색하는데, 이는 인간 암에서 가장 일반적으로 돌연변이되는 유전자입니다. 따라서 이러한 돌연변이가 어떻게 발생하는지를 밝히는 것이 가장 중요합니다.

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이 작업의 범위를 확장하기 위해 Ditso는 다른 단백질 특징을 통합하기위한 추가 요소를 도입하고 ROC 분석을 사용 하여이 모델에 대한 유효성을 테스트했습니다. 그런 다음 주어진 스피드 바카라 사이트 및 새로운 변수의 요인을 PCA (Principal Component Analysis)를 사용하여 미리 처리되었습니다. 이의 결과는 돌연변이 핫스팟의 세부 사항을 강조하였으며, 구체적으로 위치 282의 돌연변이는 암 억제제 일 수 있으며, 이들은 건강한 샘플에 존재하지만 암성 샘플에 존재하지 않았기 때문에 암 억제제 일 수있다. 또한, 암성 샘플은 245 및 176 위치에 더 많은 돌연변이를 가졌다.

주요 결과

이 핫스팟은 DNA에 결합하는 영역 주변의 TP53 유전자에 분포 되어이 결합 과정을 방해했습니다. 주어진 스피드 바카라 사이트로부터, 미스 폴딩 돌연변이는 총 돌연변이의 약 70%를 나타내는 것으로 알려져 있으며, 이로부터 DNA가 유전자에 결합하는 부위에서 변화가 발생할 수 있다고 추론 할 수있다. 그런 다음 이러한 의미를 사용하여 기계 학습 단계에서 탐색 할 잠재적 인 길을 설정하는 데 사용되었으며, 특히 돌연변이가 예측 될 수 있는지 여부와 이러한 관찰 된 패턴이 더 많은 수의 돌연변이에 적용 할 수 있는지 여부. PCA는 마침내 돌연변이를 양성 또는 해로운 그룹으로 분리하는 데 사용되었습니다.

Ditso는 가장 관련성이 높고 매우 기여하는 요인을 식별하기 위해 임의의 산림 분류기를 사용하는 기계 학습 모델을 개발했습니다. 알고리즘은 로지스틱 회귀를 사용하여 예측을하고 세 가지 다른 사례를 탐색했습니다.

1. 아미노산 위치가 잘못 쏟아짐에 따라 돌연변이 될 가능성이 있는지 여부 (가장 일반적이고 매우 정확함).
2. 샘플이 암성이든 스피드 바카라 사이트한 지 (더 도전적이고 덜 정확한 지)
3. 샘플이 양성이든 해로운지 (적당히 정확한지)

영향 및 미래의 잠재력

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추가 자원

액세스 할 수 있습니다Ditso의 공개적으로 사용 가능한 소스 코드구현 된 모든 방법에 대해.