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Diekmann 라이브스코어 바카라사이트 al., PNAS, 2017에 제시된 소규모 사회에서 정확한 연령 추정을위한 Gibbs 샘플링 접근법의 Python 구현 및 예시 입력 파일. 소스 코드는 현재 진행중인 RACAPACK에서 작업하고 있으며, 더 쉽게 사용될 수있는 R 패키지 작업을 수행하고 있습니다. ".

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r Gerbault, Gillis, Vigne, Tress라이브스코어 바카라사이트, Brehard, Thomas, 2016에 게시 된대로 죽음의 데이터 분석을 수행하기위한 스크립트.

요약 : 우리는 Dirichl라이브스코어 바카라사이트 분포의 사용을 제안하고 죽음의 다변량 그래픽 비교를 수행하기위한 접근법을 제시합니다. 우리는 사망 연령 분석에서 Dirichl라이브스코어 바카라사이트 분포가 사용될 수 있음을 보여줍니다. (i) 모든 연령층이 관찰되지 않더라도 사망률 프로파일의 각 연령층 주변에 베이지안 신뢰할 수있는 간격을 생성합니다. 및 (ii) 다중 부위를 대응 분석을 사용하여 비교할 때 각 사망 빈도 분포 주위에 95% 커널 밀도 윤곽을 생성합니다. 우리가 제시하는 통계 절차는 모든 범주 형 카운트 데이터의 분석에 적용되며, 특히 샘플 크기가 일반적으로 작은 고고 학적 데이터 (예 : 냄비, 화살표)에 적합합니다..

사망시 분석의 경우이 R 스크립트는 다음 파일과 함께 제공됩니다.

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이것은 링크 된 마이크로 위성 데이터를 사용할 수있는 클레이드에서 가장 최근의 공통 조상에 대한 시간을 추정하기위한 MATLAB/OCTAVE 기능 세트입니다. 이 방법은 뿌리 조상의 일배 체형이 알려져 있다고 가정합니다. 이 라이브스코어 바카라사이트는 Behar et al. (2003), AJHG 73 : 768-79

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이것은 단일 유전자좌에서의 일배 체형 샘플을 기반으로 두 집단 간의 유전 적 다양성 H의 유의 한 차이를 테스트하는 일련의 기능입니다. 빈번 주의자와 베이지안 솔루션은 모두 제시되며 상대적인 장점이 논의되었습니다. 기능은 Matlab/Octave 및 in에서 구현됩니다.r/s-plus. 이 라이브스코어 바카라사이트는 Thomas et al. (2002), AJHG 70 : 1411-1420

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Flip은 "인구에 대한 유연한 가능성 추론"을 나타냅니다. M.E. Weale, D.A.의 논문 "앵글로색슨 질량 마이그레이션에 대한 y 염색체 증거"에 요약 된 "Monte Carlo Ovelihood"방법을 구현하는 일련의 MATLAB/OCTAVE 기능으로 구성됩니다. 와이즈, R.F. Jager, N. Bradman 및 M.G. 토마스, 분자 생물학 및 진화 19 : 1008-1021.

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이것은 여러 인구의 일배 체형 주파수 데이터를 분석하고 인구 내에서 다양성 정도를 측정하는 통계를 계산하는 MATLAB/OCTAVE 기능 세트입니다. 인구 간의 유전자 거리를 측정하고 다양한 인구의 상당한 차이를 찾기 위해 부트 스트랩 테스트를 수행합니다.

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이것은입니다.rB가 주어진 C에서 행렬 A의 부분 상관 관계에 대한 Mantel 형 순열 테스트를 수행하기위한 루틴. 사용자는 A, B 및 C 형태를 정의합니다.이 라이브스코어 바카라사이트는 Nadkarni et al. (2005), J Biol Rhythms 20 : 490-9.

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이것은 태깅 SNP를 선택하고 평가하기위한 MATLAB 루틴 세트입니다. 가장 최근 버전에는 HAPMAP 데이터를 사용하여 대규모 후보 유전자 목록에 태깅 SNP를 선택하기위한 자동화 된 루틴이 포함됩니다. Tagit에서 구현 된 방법은 Weale 라이브스코어 바카라사이트 al. (2003), AJHG 73 : 551-565, Goldstein 라이브스코어 바카라사이트 al. (2003), 유전학 경향 19 : 615-622 및 Ahmadi 라이브스코어 바카라사이트 al (2005), Nature Gen라이브스코어 바카라사이트ics 37 : 84-89.

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이것은 관심있는 SNP 주변의 관련 간격의 경계에 대한 베이지안 추정을위한 정해진 윈 버그 루틴입니다. 관련된 간격은 다른 SNP가 지명 된 SNP와 함께 추정 기능으로 간주되는 충분한 LD에있는 영역으로 정의됩니다. ASSOCINT에서 구현 된 방법은 Soranzo 라이브스코어 바카라사이트 al. (2004), 게놈 연구 14 : 1333-44.

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