온라인바카라식물과 농작물

유전학, 진화 및 환경의 온라인바카라 연구부는 식물, 특히 작물에 대한 광범위한 연구를 수행합니다.

자연 선택을 통한 식물의 진화와 인공 선택에 의한 작물의 개선은 동일한 동전의 양면을 나타내며, GEE의 연구 프로그램은 두 측면을 모두 탐구합니다. 우리는 식물 진화 (Jon Bridle), 고대 작물 식물 DNA (Hernán Burbano and Richard Mott) 및 실험 간 교차 (Richard Mott)에 대한 경험적 연구의 조합을 사용하여 적응과 가축의 온라인바카라학을 해부합니다.

이 작업은 자연 생태계와 농업에 대한 기후 변화에 의해 유발 된 중요한 도전을 감안할 때 특히 관련이 있습니다.

환경 변화에 대한 식물 반응 : 생태 학적 마진에서 식물 행동의 진화 조사

식물이 변화하는 환경에 반응하는 방법은 생태계의 탄력성을 이해하고 점점 더 스트레스가 많은 환경에서 농작물 수확량을 유지하는 데 근본적인 문제입니다. 온라인바카라의 연구 그룹, 이끄는Jon Bridle, 게놈, 생태 학적 및 정량적 온라인바카라자 분석의 조합을 사용하여 2의 적응 소성에 대한 한계를 테스트합니다SenecioRagwort 종.

우리는 옥스포드, 카타니아, 나폴리 대학과 협력하여 NERC 자금을 조달 한 프로젝트의 일환으로 시칠리아 산에있는 온라인바카라자형 이식과 시칠리아 산의 광범위한 이식을 수행하고 Piante Faro의 친절한 지원 (이탈리아 Giarre). 이 결과는 다른 생명 단계에서의 체력과 지상의 아래 및 지상 행동 사이의 트레이드 오프뿐만 아니라 어떤 새로운 형태의 적응 소성이 각 종의 기존 생태 마진을 넘어 진화 할 수 있는지 쉽게 나타냅니다.

옥스포드, 카타니아, 모나 쉬 및 나폴리 대학교의 공동 작업자와 함께, 온라인바카라는 현재 생태 범위 내에서 이러한 종의 행동 반응의 한계를 테스트하기 위해 대규모 이식 실험을 수행하고 있습니다.

전계 이식 절단의 전 사체 분석은 또한 최근의 적응 형 발산과 그 이후의 온라인바카라자형 내에서 이들 종들 사이에서 식물 행동의 게놈 구조를 탐색 할 수 있습니다. 온라인바카라자 네트워크에서 이러한 변화를 표현형 및 인공 선택의 한계를 이해하기 위해 온라인바카라자 네트워크의 이러한 변화를 이러한 환경에서 특성 상관 관계 및 트레이드 오프의 변화와 관련시키기위한 노력이 진행 중입니다.
행동 진화.

Burbano Lab

온라인바카라 그룹은 후 향적 접근 방식을 사용하여 식물과 병원체의 진화에서 광범위한 질문을 해결합니다. 이 접근법은 과거와 고대 샘플 시퀀싱을 통해 직접 관찰을 얻고 현재의 게놈 정보와 결합하여 힘을 얻습니다.

현재 및 과거의 식물성 전염병의 역학 : 과거 전염병의 역학과 식물-경과 상호 작용의 공동 진화에 대한 연구는 식물성 질환의 출현과 재발이 식량 안보에 대한 주요 위협과 인간 건강에 대한 간접적 인 위협이기 때문에 주요 관련이 있습니다. 또한, 식물-경사 체계에 의해 경험되는 자연 및 인공 선택의 강도는 단기간에 대립 온라인바카라자 빈도의 변화를 관찰 할 수있게한다..

온라인바카라 그룹은 감자 늦은 Blight의 인과 관계 에이전트 인 Phytophthora Infestans에 의한 19 세기와 20 세기의 발발 연구를 중심으로했습니다 (Yoshida et al. 2013, Elife;Yoshida et al.) 및 쌀 폭발 곰팡이 magnaporthe oryzae (Latorre et al. 2020, BMC 생물학).
1847 년에 아일랜드 기근의 높이 기간 동안 수집 된 Kew Garden Herbarium의 감자 표본. © Marco Thines/Senckenberg Gesellschaft für Naturforschung
농작물 가축화와 농업의 확산에서 주요 사건의 식별 및 타이밍 : 고대 게놈과 정량 및 인구 온라인바카라학을 결합한 접근법을 사용하여, 우리 그룹은 북아메리카의 옥수수 확산과 온화한 기후에 대한 적응을 특성화하기 시작했습니다. 번식에서 빌린 기술을 사용하여 (게놈 선택) 우리는 처음으로 고고 학적 유물에 대한 다형성 정량적 특성을 예측했습니다 (Swarts et al. 2017, 과학).

아메리카에서 길 들여진 작물의 사후에 분산은 식물의 인구 역사와 적응을 연구 할 수있는 독특한 기회를 제공합니다. 온라인바카라 그룹은 오늘날과 역사적 게놈을 결합한 유럽 감자의 인구 역사를 자세히 구사했습니다.Gutaker et al, 2019, 자연 생태 및 진화).
찰스 다윈 (Charles Darwin)이 비글의 항해로 칠레에서 수집 한 감자 (Solanum tuberosum) 표본 표본. © Cambridge University Herbarium.
침습적/도입 종에 의한 새로운 생태 학적 틈새 시장의 식민지 : 우리 그룹은 최근에 도입 된 종에서 온라인바카라자 변이를 가진 진화 세력을 검사하기 위해 19 세기와 20 세기에 걸친 조밀 한 시계를 사용하여 애기 장대 시대를 사용하여 북미의 식민지를 탐구했습니다. 우리는 장기 핵 돌연변이율을 추정했으며 온라인바카라자 드리프트가 우세하지만 정화 선택은 또한이 식민지 집단에서 다양성을 형성 함을 보여 주었다 (Exposito-Alonso et al., 2018. PLOS 온라인바카라학).

Richard Mott Group

1. 온라인바카라는에서 연구를 수행합니다.다가구 인구. 이들은 여러 근친 창립자 (Magic : Match : Multiparent Advanced Generation Inter Cross)의 후손 인 재조합 된 근친 교배 패널입니다.

(a)Arabidopsis MagicPaula Kover (Bath of Bath)와 공동으로 개발되었습니다. 온라인바카라는 최초의 인구의 19 명의 창립자를 시퀀싱했습니다팬 게놈 연구. 온라인바카라는 인구의 저지로 시퀀스를 사용하여 방법을 보여주었습니다.맵 구조적 변형.

(b) 다양한 밀 마법은 Cambridge의 National Institute for Agriculture Botany (NIAB)의 James Cockram 및 동료들과 협력하여 개발되었습니다. 인구는 지난 70 년 동안 영국에서 자란 주요 품종을 샘플링하도록 설계되었습니다.130 개 이상의 정량적 특성 위치인구.

(c) Rice Heat Magic은 필리핀 국제 Rice Research Institute에서 열차와 관련된 온라인바카라자좌를 식별하기 위해 개발되었습니다. 우리는 낮은 적용 범위에서 800 개 이상의 라인을 시퀀싱했으며, 이는 익숙한Chalkiness와 관련된 위치 식별.

2. 온라인바카라는 Rajeev Varshney 및 병아리 콩 인구 시퀀싱에 대한 반 건조 열대 지방 (Icrisat, India)을위한 국제 작물 연구소의 동료들과 협력하고 있습니다.

(3) 우리는 고대 작물 게놈에 관심이 있습니다. Mark Thomas, 온라인바카라 고고학 부서 및 온라인바카라 이집트 고고학 박물관의 Dorian Fuller 및 동료들과 협력하여 우리는 Ramessid 시대부터 3,000 년 된 Emmer Wheat의 표본을 시퀀싱하고 대부분의 유전자 서명을 보여줍니다.그 날짜까지 수정되었습니다. 유 전적으로 인도, 오만 및 터키에서 자란 현대식 에머 밀과 유사합니다.

야생 친척과 비교할 때 길 들여진 밀은 더 큰 입자를 가지고 쉽게 발아합니다. 씨앗은 또한 식물에 강력하게 붙어 있습니다 (그림에 흉터가 찍힌). 더 쉽게 수확 할 수 있습니다.