사설 바카라 나노 스트링 시설은 연구 커뮤니티를위한 NCOUNTER 기술에 대한 액세스를 제공하기 위해 설립되었습니다. 이 시설은 사설 바카라 플랫폼 기술 이니셔티브 보조금에 대한 기원을 빚지고 있으며 GEE 부서에서 관리합니다.
Covid-19 : 사설 바카라 Nanostring 시설은 직원이 운영하는 외부 서비스를 위해 열려 있으며 교육을받을 수 없습니다.
NCOUNTER SYSTEM
NCOUNTER 시스템에서Nanostring Technologies디지털 바코드 기술을 기반으로 한 핵산 (DNA 및 RNA)의 직접적이고 신뢰할 수 있으며 민감한 다중 측정입니다.
NCOUNTER 시스템은 완전히 자동화되어 있으며 단일 반응에서 수백 개의 분자를 감지하고 세는 단일 분자 영상화와 단일 분자 영상화를 사용하여 형광 표지 된 리포터 프로브를 사용합니다. 이 시스템은 RNA 사설 바카라의 열악한 품질에 매우 저항력이 있으며 FFPE (포르말린 고정, 파라핀-흡착 된) 사설 바카라에서 추출한 RNA에 완벽하게 적합합니다..
NCOUNTER 기술은 실시간 PCR (RT-PCR)과 비교할 수있는 민감도와 특이성을 가지며 NG보다 빠릅니다. 이 기술은 잘 이해 된 핵산 혼성화 반응을 활용하고 효소 반응이 관여하지 않으며 역전사 또는 DNA 증폭이 필요하지 않습니다..

사설 바카라의 NCOUNTER 서비스에 대한 문의는 다음 이메일 주소를 사용하십시오 :nanostring@사설 바카라.ac.uk.
Paola Oliveri | 시설 책임자 |
Fraser Simpson | 기술 직원 |
Wendy Hart | 기술 직원 |
Codeset Design and 주문은 NanoString에 직접 문의하십시오 : Xavier Tait (이메일) 또는xtait@nanostring.com
나노 스트링 기술은 NGS 및 마이크로 어레이 데이터의 검증을위한 완벽한 도구입니다. 제한된 양의 물질로부터 다수의 유전자의 정량화;
유전자 발현 분석
사전 조립 및를 사용하여 총 RNA 풀에서 특정 전 사체의 정량화즉시 사용 가능한 패널또는 유연성사용자 정의 코드 세트. 총 RNA, FFPE, 세포 용 해물, 혈장, 혈청 등과 호환됩니다.
miRNA 프로파일 링
Micro-RNA의 정량화준비 패널최대 800 개의 목표 또는 인간, 마우스 및 쥐의à la carte 옵션최대 50 개의 사용자 정의 선택된 miRNA 프로브가 있습니다. 혈청, 혈장, FFPE, 조직, 세포 및 엑소 좀의 miRNA와 호환
MIRGE ™ (miRNA & mRNA) 분석
mRNA 및 miRNA동시 정량화. 혈청, 혈장, FFPE, 조직, 세포 및 엑소 좀의 총 RNA와 호환됩니다.
Vantage 3D
조합의 동시 정량화DNA, RNA 및 단백질단일 사설 바카라에서 최대 800-Plex를 대상으로합니다.
사설 바카라 나노 스트링 시설은 모든 대학, 연구소 및 개인 회사에 개방되어 있으며 다음 유형의 서비스를 제공합니다.
- Full NConter Service : 사설 바카라 숙련 된 직원이 샘플 품질 관리에서 초기 데이터 분석에 이르기까지 모든 단계를 수행합니다.
- NCounter Machine Training : 연구원은 처음 12 개의 사설 바카라에 NCOUNTER MACHINE 사용에 대해 교육을 받았습니다. 그/후에 다른 사설 바카라을 실행하기 위해 기계에 액세스 할 수 있습니다.이 서비스는 코비드 제한으로 인해 일시적으로 중단됩니다)
- 데이터 분석 : 백그라운드 보정 및 정규화는 Excel 형식으로 제공됩니다.
- 데이터 분석 교육 : Excel을 사용하여 데이터 분석에서 훈련을받습니다.
모든 소모품과 시약을 포함하여 NCounter 마스터 키트를 포함하는 상용 프리 조립 프로브 세트의 경우, 제발NanoString에 문의하십시오직접.
맞춤형 프로젝트의 경우 코드 세트의 프로브는 RefSeq ID 또는 FASTA 시퀀스를 기반으로 NanoString Bioinformaticians가 설계했습니다. 이 형식은 최대 800 개의 목표 시퀀스와 48 또는 96 반응 또는 배수에 대해 사용할 수 있습니다.
NCOUNTER 코드 세트에는 내부 QC, 교정 및 배경 평가에 사용되는 양성 대조군 (코드 세트에 10 개의 RNA 스파이크) 및 음성 대조군 (외계인 시퀀스에 대한 7 개의 프로브)이 포함되어 있습니다.
RT PCR과 유사하게, 정규화 유전자에 대한 프로브는 코드 세트에 포함되어야합니다. 사전 지식에 따라 선택해야합니다.
프로세스 시작 방법
이번이 처음으로 서비스를 사용하는 경우 사전에 시설에 연락하십시오이메일프로젝트 아이디어에 관한. 우리는 귀하가 가질 수있는 모든 질문에 답변하고 귀하의 요구에 가장 적합한 기술에 대해 조언 할 수 있습니다.
서비스 유형에 동의 한 후에는를 작성하십시오.등록 양식. NanoString에서 직접 필요한 코드 세트를 주문할 것입니다.
사설 바카라 준비 방법
Ncounter 정량화에는 최소량의 RNA/DNA 사설 바카라이 필요합니다. 자세한 내용은 아래 표를 참조하고를 다운로드하십시오.
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사설 바카라 준비 요약
응용 프로그램 | 시작 재료 | 권장 사설 바카라 농도 | 입력 금액 분석 | 분석 당 필요한 총 금액* |
유전자 발현 | Total RNA | 20 ng/µl -100 ng/µl | 100 ng | 150 ng |
Cell Lysate | 2,000-10,000 세포/µL | 10,000 세포 | 15,000 세포 | |
FFPE RNA | 20 ng/µl -100 ng/µl | 100 ng | 150 ng | |
mirna | 정제 된 총 RNA 만 | 33 ng/µl -100 ng/µl | 100 ng | 150 ng |
ffpe RNA | 33 ng/µl -100 ng/µl | 100 ng | 150 ng | |
CNV | 정제 된 게놈 DNA 전용 | 17999_18013 | 600 ng | 650 ng |
*사설 바카라을 NanoString으로 배송 할 때는 필요한 경우 죽은 볼륨 피펫 팅 및 추가 사설 바카라 QC를 설명하기 위해 추가 50 ng의 재료를 제공하십시오. 기술적 복제 재료는 단일 튜브 또는 플레이트에 잘 제공 될 수 있습니다.
RNA 사설 바카라의 품질 관리는 Bioanalyzer를 사용하여 추가 비용으로 수행 할 수 있습니다. 이 경우 우리는 최소 300 ng RNA (20-100 ng/ul)의 양을 요청해야합니다.
카트리지를 읽으려면 카트리지 제출 양식을 작성하십시오.
참고 : 모든 가격은 통지없이 변경 될 수 있습니다.
고객은 모든 소모품, 사설 바카라 처리, 데이터 생성 및 처리에 대한 서비스 수수료를 지불해야합니다. 가격은 시설에서 제공하는 실험 및 서비스 유형에 따라 다릅니다.
방금 표준 서비스를 수행 한 경우 출판의 승인 섹션에서 서비스를 인용하십시오. 다음 진술이 사용될 수 있습니다.
"우리는 NCounter 시스템 및 관련 서비스 제공에 대한 사설 바카라 NanoString 시설에 감사합니다."
사설 바카라 당 또는 실험 당 가격은?
- 우리의 pricelist는 가격/사설 바카라 또는 가격/카트리지를 제공합니다 (= 12 사설 바카라).
내 사설 바카라에서 RNA를 추출합니까?
- 우리 시설은 RNA 추출 서비스를 제공하지 않습니다.
데이터 분석을 제공합니까?
- 우리는 초기 데이터 분석, QC 및 카트리지 정규화를 제공하지만 고급 데이터 분석을 제공하지는 않습니다.
결과를 얻는 데 얼마나 걸립니까?
- 이미 서비스가 얼마나 바쁜지에 따라 다릅니다. 12 개의 사설 바카라의 워크 플로우는 48 시간이 걸립니다.
나노 스트링 머신 사용 훈련을받을 수 있습니까?
- 예, 우리는 48 개의 사설 바카라 중 더 큰 프로젝트에 대해서만 연구 경험 (예 : POSTDOC)을 훈련시킵니다. (이 서비스는 Covid-19 제한으로 인해 일시적으로 중단되었습니다)
RNA 코드 세트를 주문하기 위해 NanoString과 별도의 수수료를 지불해야합니까? 아니면 인용 된 가격에 포함되어 있습니까?
- 사설 바카라 견적에는 실험 실행 수수료 만 포함됩니다. 시약은 나노 스트링에서 직접 구매해야합니다.
런당 분석 할 최소 사설 바카라 수가 있습니까?
- 아니요, 그러나 우리는 카트리지에 12 개의 우물을 모두 사용하는 것이 좋습니다. 그렇지 않으면 손실 될 것입니다.
최대 800 개의 유전자에 대한 사설 바카라 당 가격이 있습니까? 또는 가격은 분석 된 유전자 수에 따라 다릅니 까?
- 가격/사설 바카라은 pricelist에 표시되어 있으며 코드 세트에 존재하는 유전자의 수에 따라 변하지 않습니다.
30-50 유전자를 실행하기 위해 얼마나 많은 RNA를 제공해야합니까?
- 필요한 RNA 양은 30 개 또는 800 개의 유전자에 대해 동일하며 에세이 유형에 따라 다릅니다.
데이터는 어떤 형식으로 데이터를 받습니까? 처리가 완료 되었습니까?
- 우리는 데이터를 2 가지 형식으로 보냅니다.
사설 바카라 실행에 대한 대기자 명단이 있습니까?
- 그것은 연중 순간에 따라 다릅니다. 일반적으로 예.
22160_22222
- 당신은 순서를 Fasta 형식으로 나노 스트링에 제공 할 수 있습니다.