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CDT의 바카라사이트 온카판 및 감시 테마는 빠른 바카라사이트 온카판 테스트, 디지털 건강 및 개선 된 감시 시스템의 개발 및 테스트에 중점을 둘 것입니다
AMR의 조기 탐지 및 바카라사이트 온카판은 항균 청지기 직분, 공공 보건 감시 및 전염을 방지하는 데 중요합니다. 그러나 많은 중요한 엔지니어링 과제가 남아 있습니다. 예를 들어, 항균성 및 감수성을 결정하기 위해, 현재의 "금 표준"방법은 샘플 수집 후 36-72 시간의 처리 시간이 필요한 중앙 집중식 실험실에서 박테리아 배양에 종종 의존합니다. 이것은 응급 환경이나 짧은 클리닉 방문에서 효과적인 항생제 청지기 직분에 비해 너무 느립니다. 측면 흐름 테스트는 공중 보건을위한 중요한 도구로 등장하고 있지만, 많은 사람들은 초기 단계 감염을 감지 할 민감도와 데이터를 의료 시스템에 연결하는 디지털 연결성이 부족합니다. 더욱이, 대부분의 AMR 연구는 병원의 전자 환자 기록에 기반한 인간의 사례에 초점을 맞추기 때문에 동물과 환경에서 AMR의 상호 연결성에 대해서는 상대적으로 거의 알려져 있지 않습니다..
이러한 과제를 해결하기 위해 새로운 엔지니어링 솔루션이 시급히 필요합니다. 이들은 다양한 분산 환경 (예 : GP 수술, 간호 주택, 가정에서의 자체 테스트, 펜 및 폐수 바카라사이트 온카판)에서 AMR을 감지하기 위해 빠른 초광에 민감한 테스트의 생성을 다루어야하며, 인간, 동물, 동물 및 환경 사이에 사일로 된 데이터 세트를 개선하기위한 발병의 바카라사이트 온카판가 필요합니다.
바카라사이트 온카판 테마 연락처 :
교수. Rachel McKendry & Dr. Mike Thomas
2025 프로젝트
- 초증성 및 빠른 항균 감수성 검사를위한 증폭 전략 개발
감독자
프로젝트 세부 사항 :
항균 감수성 테스트 (AST)는 효과적인 항균 관리의 핵심입니다. 일반적으로 박테리아 배양에 의존하며, 이는 긴급 상황을 초래하는 데 시간이 1-7 일이 걸릴 수 있습니다. 새로운 바카라사이트 온카판 분석법은 저항성 유전자에 대한 분자 시험 또는 박테리아-특이 적 단백질 결합에 중점을 둔 세균 감염을 조기에 그리고 비용 효율적인 방식으로 탐지하는 것을 목표로한다. 최근의 예에는 내성을 담당하는 효소 기계를 표적으로하는 측면 흐름 분석 (LFA) 시험이 포함되어 18-24H 박테리아 배양의 내성을 식별하는 데 높은 감도와 특이성을 제공합니다. 1 그러나 더 쉬운 항 미생물 관리를위한 더 빠른 방법이 필요합니다. 여기서 우리는 화학적 증폭을 가능하게하여 AST를위한 빠르고 저렴한 LFA의 민감도를 높이고 배양의 필요성을 줄일 수 있도록 새로운 경로를 설계 할 것입니다.
우리는 탐지에 필요한 AST 및 박테리아 하중에 필요한 양의 항생제를 최소화하기 위해 빠른 테스트 형식으로 바이오 분석을 축소하는 데 중점을 둘 것입니다. 이 바카라사이트 온카판는 E.Coli와 같은 모델 박테리아 플랫폼을 삽입하거나 결석 한 모델 박테리아 플랫폼을 활용할 것입니다. 변환 바카라사이트 온카판에 공통적 인 이러한 모델 시스템을 통해 학생은 박테리아의 저항 기계를 조사 할 수 있습니다. 이 기계에 구체적으로 반응 할 수있는 시약은 설계 및 생산 될 것이며, 결과 분석은 CFU/mL 검출 한계에 대해 평가/최적화되었습니다. 우리는 최근에 다양한 형식으로 사용 된 유사한 면역 분석의 전산 모델을 개발했으며 측면 흐름 분석 개발에 대한 폭 넓은 경험을 가지고 있습니다. 2-6 특히 우리는 RAPING AST를 발전시키기위한이 흥미로운 접근 방식을 잘 해결하기 위해 민감도를 향상시키는 화학적 변형에 반응하는 LFA에 대한 전문 지식을 가지고 있습니다.
이 학제 간 프로젝트는 합성 생물학, 박테리아 배양, 단백질 공학, 면역 분석 개발 및 측면 흐름 분석 장치 공학에 대한 전문 지식을 개발할 것입니다. 학생은 또한 SDS-PAGE, 크로마토 그래피, ELISA와 같은 표준 분석 바카라사이트 온카판을 배우고 자동화 된 액체 처리 및 시뮬레이션 (MATLAB) 바카라사이트 온카판을 적용하여에서 개발 된 디지털 트윈 시뮬레이션 적용을 지원할 수있는 기회가 있습니다.Thomas실험실. 학생은 또한 출판을 통해 우수한 음성 및 서면 의사 소통 바카라사이트 온카판을 개발하고 주요 국제 회의에 참석할 것으로 기대할 수 있습니다.
학생들ThomasandFrankUCL의 실험실은 매주 및 그룹 회의 중에 감독자와 상당한 실습 시간을 가진 육성 환경의 혜택을받습니다. 박사 학위 학생들은 특히 논문 및 출판물에 대한 긴밀한 모니터링 및 지원을받습니다. 학생들은 바카라사이트 온카판 기술, 데이터 과학, 생물 제조 등에 대한 다양한 과정에 참석하여 분자 생물학 기술도 업계 준비가되도록 광범위한 기술을 개발할 수 있습니다. 이 프로젝트는 또한의 광범위한 시설에 대한 접근 혜택도 있습니다.사설 바카라 | UCL 생화학 공학과 -UCL - University그리고 Bionano 실험실에서나노 바카라사이트 온카판을위한 런던 센터. 학생은 EDI, 학생 복지 및 전문성 개발에 중점을 둔다.
1) Hazim et al. 분자 바카라사이트 온카판 저널, 22 (9), 1129 (2020)
2) Loynachan et al. ACS Nano 2018, 12, 1, 279.
3) Budd, J et al. Nat Rev Bioeng 1, 13-31 (2023)
4) Richards, D et al. Nanoscale, 13, 11921 (2021)
5) Miller, BS et al. Biosensors & Bioelectronics, 207, 114133 (2022).
6) Ayrton, JP et al. Nanoscale, 16, 19881 (2024).
- 지역 사회에서 요로 감염의 조기 바카라사이트 온카판을위한 멀티플렉스 된 측면 흐름 분석 장치.
감독자
프로젝트 세부 사항 :
요로 감염 (UTIS)은 전 세계에서 가장 흔한 전염병 중 하나입니다. 1 차 진료 환경에서, UTI는 일반적으로 딥 스틱 테스트를 통해 바카라사이트 온카판되며, 이는 경험적 항생제 처방로 이어질 수 있습니다. 그러나, 딥 스틱 검사는 특정 병원체를 식별 할 수 없으며, 광범위한 항생제의 사용은 다제 내성 유기체의 발달을 선호 할 수있다. 현재의 측면 흐름 분석 (LFA) 기술은 제한된 정확도로 인해 커뮤니티 환경에서 UTI 바카라사이트 온카판에 부적절합니다.
이 프로젝트는 딥 스틱의 신속하고 경력이있는 바카라사이트 온카판 정보와 전통적인 시간 소모적 인 실험실 기술에 의해 제공되는 바카라사이트 온카판 정보의 신속하고 광범위한 바카라사이트 온카판 정보를 결합한 1 차 바카라사이트 온카판에서 UTI 바카라사이트 온카판을위한 새로운 LFA 장치를 개발하는 것을 목표로합니다. 이러한 기술 혁신을 전달하기 위해, 새로운 효소가없는 DNA 증폭 전략은 LFA 테스트 형식의 전력이없는 전기 성 증폭 전략과 결합 될 것이다.
프로젝트 목표는입니다.
- DNA/RNA 표적과의 상호 작용에 따라 많은 표지 된 화합물을 빠르게 방출하는 새로운 효소가없는 DNA 증폭 전략 [1].
- Electrokinetic Effects [2]에 의해 테스트 라인에서 릴리스 된 라벨이 붙은 제품을 축적하는 LFA 장치를 설계하고 최적화합니다.
- UTI 병원체 및 항생제 저항성 바이오 마커의 신속하고 초경성 양적 다중화 된 다중 변호를위한 비색 LFA 프로토 타입을 검증합니다.
이러한 혁신적인 LFA 장치는 감염성 질환의 빠르고 저렴하고 널리 접근 할 수있는 조기 바카라사이트 온카판을 가능하게하고, 이환율 및 사망률을 줄이고, 건강 관리 비용을 낮추고, 지역 사회에서 AMR의 탐지를 향상시켜 NHS를 지원할 수 있습니다.
프로젝트 목표를 전달하기 위해 학생은 여러 분야 (예 : DNA 나노 바카라사이트 온카판, 콜로이드 및 인터페이스 과학, 미세 유체)에서 기본 지식을 개발하고 (i) 핵산 및 분석을 포함한 학제 간 바카라사이트 온카판 바카라사이트 온카판을 습득 할 것입니다. 장치. 학생은 광범위한 실험 바카라사이트 온카판 (겔 전기 영동, 전자/광학 현미경, 광 산란, 레이저 제조, 분광학 및 디지털 이미지 분석)을 채택하고 데이터 분석을위한 주요 프로그래밍 바카라사이트 온카판을 습득 할 것입니다.
학생이 Bollognesi 박사에 합류합니다입자 미세 유체 그룹and the부스 바카라사이트 온카판 그룹영국과 해외의 Bolognesi 박사 및 Dr Booth의 학업 및 산업 공동 작업자 네트워크와 협력 할 것입니다.
참조
[1] G. Xu, M. Lai, R. Wilson, A. Glidle, J. Reboud 및 J.M. Cooper, 분지 하이브리드 화 연쇄 반응-라벨이없는, 휴대용, 다중 분자 바카라사이트 온카판에 대한 고 차원 DNA 나노 구조를 사용합니다. Microsystems & Nanoengineering, 2019, 5, 37.
[2] A. Chakra, N. Singh, G.T. Vladisavljevic, F. Nadal, C. Cottin-Bizonne, C. Pirat 및 G. Bolognesi. 단일 및 이중 접합 마이크로 채널에서 확산 영양을 통한 콜로이드 비드 및 리포좀의 지속적인 조작 및 특성. ACS Nano 2020, 17, 14644-14657.
- 항생제 모니터링의 침대 옆 수준 (Bedlam).
감독자
프로젝트 세부 사항 :
이론적 및 배경 : 감염은 전 세계 사망의 20%를 유발하는 장기 기능 장애 (패혈증)로 이어질 수 있습니다. 치료 메인 스테이는 항생제이지만 항균성 저항성 (AMR)이 증가하고 새로운 옵션이 부족하면 더 나은 청지기 직분과 기존 약물의 사용이 더 잘 사용됩니다. 항생제 처방은 중증 간 및/또는 신장 기능 장애가있는 사람의 임의 용량 감소를 갖는 1 가지 용량 적합 전략을 기반으로합니다. 가장 흔한 항생제 클래스 (ß- 락탐)의 혈중 수준은 병원 실험실에서 일상적으로 측정되지 않습니다. 그러나, 바카라사이트 온카판에 따르면 약물 대사가 변경되어 상당한 수의 집중 치료 환자에서 최적의 또는 과도한 혈액 수준이 나타납니다. 이는 (i) 감염을 과도하게 처리하는 위험을 증가시켜 사망을 초래하고 AMR을 유도 할 가능성이 증가하고; 및 (ii) 과잉 투여로 인한 부작용.
목표 및 목표 : 우리는 침대 옆 모니터를 개발하여 몇 분 안에 ß- 락탐 혈액 수준을 측정하여 최적의 효과에 대한 약물 투약의 빠른 적정을 허용합니다. 이 프로젝트를 뒷받침하는 파일럿 바카라사이트 온카판에서, 우리는 Aptamer 기술을 사용하여 스파이크 혈액 샘플에서 10 분 이내에 ß-lactam 항생제, meropenem을 측정 할 수 있습니다. 이것은 그들의 높은 친화력과 조정 가능한 특성을 사용하며, 트랜스 듀서의 감도가 크게 영향을받습니다. 우리는 저렴한 비용으로 규모로 처리 될 수있는 전도성 폴리머 (바이오 센서 개발에 널리 사용됨)를 사용하여 이것을 추가로 개발하고자합니다.
CDT 학생은 감지 전극, 재료 및 화학의 구조를 최적화하여 임상 전자기 및 알고리즘을 생성하여 임상 파트너와 공동 작업하여 바이오 센서 판독 값을 분석하여 임피던스 바이오 센서를 더욱 발전시킬 것입니다. 학생은 이러한 다 분야 바카라사이트 온카판 영역에서 기술을 습득 할 것입니다. 지적 재산은 새로운 폴리머, 바이오 센서 구성 및 판독 전자 장치의 사용에 대해 구할 것입니다. 체액 및 조직에서 ß- 락탐 측정을 탐색하여 정화조 및 건강한 동물의 장기의 항생제 수준을 평가할 것입니다. 이것은 우리의 잘 확립 된 실험실 모델에서 쉽게 달성 할 수 있으며, 성공적인 학생은 원하는 경우 생리 학적, 생물학적 기술을 개발할 수있는 기회를 갖게 될 것입니다.
프로젝트 계획 :
- 비판적으로 아픈 환자로부터 혈액을 얻고 새로운 바이오 센서의 민감도와 특이성을 테스트하기 위해 큰 바카라사이트 온카판를 수행합니다 [Y3]
- 센서 판독 전자 제품 및 처리 알고리즘 개발 [Y2-Y3]
- 초기 환자 샘플 평가를 수행하기위한 윤리적 허가 확장 [Y2]
- Meropenem과 함께 자원 봉사 혈액/혈장을 사용한 공연을 조사하십시오. 제자리에있는 윤리 [Y1-Y2]
- 항생제 수준을 감지하기 위해 바이오 센서 커플 링 화학 개발 [Y1]
- 실험실 모델에서 장기 침대에서 항생제 수준 평가 [Y4]
참조 :
- 단일 테스트 항균성 저항 바카라사이트 온카판 및 모니터링에 대한 병원 폐수 메타 게놈 시퀀싱
감독자
프로젝트 세부 사항 :
병원 폐수에서 항균성 저항성을 이해하기 위해 메타 게놈 시퀀싱을 사용하는 Magic Wands 바카라사이트 온카판는 이미 페루에서 출시되었습니다 (그림 1). 이 프로젝트의 성공적인 신청자는 페루를 방문하여 약물 내성 테스트 및 새로운 병원체 발견을 위해 영국 병원에서이를 적용하는 데 필요한 메타 게놈 기술을 배울 수있는 기회를 갖게 될 것입니다..
근거 및 배경: 지난 10 년 동안 두 명의 감독자 인 GREAM ORMOND Street Hospital (GOSH) AMR (Advanced Antimicrobial Resistance) 바카라사이트 온카판 시스템은 모든 환자가 병원체에 대한 최후의 라인 요법에 내성이있는 모든 환자에 의해 시행되었습니다. 맞춤형 전자 환자 기록을 사용한 자동보고를 통해 직원은 살아있는 AMR 데이터를 기반으로 대체 예방 또는 치료를 선택할 수 있습니다. 그러나 AMR의 병원 광범위한 바카라사이트 온카판는 비용이 많이 들고 노동 집약적이며 시간이 많이 걸립니다. 단일 테스트에서 폐수 메타 게놈 바카라사이트 온카판는 병원 수준 AMR을 비용 효율적으로 평가하고 동시에 병원 발생을 감지 할 수있는 잠재력을 가지고 있습니다.
목표와 목표:이 프로젝트는 의료 시설에서 AMR에 대한 스크리닝 테스트로 병원 수준의 폐수 메타 게놈 시퀀싱을 배치합니다. 다음과 같은 결과가 전달됩니다.
1) 병원 전체 AMR의 저항 유병률 및 메커니즘을 검출하기위한 병원 폐수 메타 게놈 시퀀싱의 성능을 정의합니다.
2) 광범위한 표적 병원체에 대한 미끼 캡처 세트를 사용하여 시퀀싱의 민감도를 최대화합니다.
3) 맞춤형 프라이머를 사용하여 표적 유기체에서 전체 게놈을 증폭하여 병원체 수준에서 AMR을 특성화합니다.
방법 및 토대 :마법-웨드 바카라사이트 온카판 :
/어린이 건강/마술-웨이드-스튜디 마이크로 조직 및 그램 음성 감염 제어
이 바카라사이트 온카판 - Wellcome Trust의 자금 지원을받은 UCL에 기반을 둔 PI 교수 Louis Grandjean이 이끄는이 바카라사이트 온카판는 이미 PERU의 월간 병원 폐수 시퀀싱을 수행하여 최신 옥스포드 나노 포어 (ONT)를 사용하여 가장 위험한 병원 저항성 감염을 신뢰할 수 있고 정량화 할 수있는 탐지를 가능하게합니다. 동시에 Gosh의 기존 AMR 스크리닝 프로그램의 일부로 스크리닝 된 입원 입원 환자로부터 그램 음성 분리 물의 전체 게놈 시퀀싱을 수행 할 것입니다. 내성 감염의 평가 및 치료 센터 (Centri) :
Gosh의 Lead Supervisors (Grandjean and Hatcher)가 이끄는 Centri는 자동화 된 Hamilton Star를 사용하여 높은 처리량 DNA 추출 및 샘플 처리를위한 파이프 라인을 잘 확립했습니다. Yale University와의 오랜 협력을 통해 우리는 관심있는 유기체를 탐지하고 특성화하기 위해 맞춤형 미끼 캡처 세트와 게놈 스패닝 프라이머를 평가할 수 있습니다.
바카라사이트 온카판 개발 및 학생 경험 :이 자금 지원 상을받은 학생은 역동적이고 친근한 팀에 합류하여 역학, 현장 작업, 미생물학, 분자 생물학, 생물 정보학, 데이터 분석, 보조금 및 원고 준비에 대한 바카라사이트 온카판과 경험을 구축 할 수 있습니다. 학생은 또한 페루의 실험실을 방문하여 이미 이러한 바카라사이트 온카판을 이미 구현하고 실험실 팀으로부터 배우도록 지원됩니다.
영향 :이 제안은 최신 폐수 게놈 바카라사이트 온카판과 함께 GOSH의 최첨단 AMR보고를 결합하여 병원 수준에서 AMR의 민감하고 재현 가능한 감시 및 정량화를 가능하게합니다.
- 항균제를 감지하고 분리하는 광학 방법 개발
감독자
프로젝트 세부 사항 :
항균성 저항 (AMR) - 현대 의학이 직면 한 가장 큰 도전으로 여겨지는 것은 2050 년까지 매년 천만 명이 사망 할 것으로 예상된다 [1,2]. 이미 박테리아 감염은 전 세계 8 명 중 1 명 이상을 담당합니다 [2]. 박테리아 집단이 유전자 저항성없이 항생제에서 생존하는 항균 지속성의 현상은 AMR보다 훨씬 광범위하지만 여전히 수수께끼로 남아 있습니다.
지속성은 성장을 일시적으로 중단하는 박테리아 세포의 작은 부분 집합을 포함하여 항생제 치료에서 생존하고 잠재적으로 성장을 재개하여 재발 및 만성 감염을 유발할 수 있습니다 [3,4]. 지속성을 바카라사이트 온카판하기위한 현재의 금 표준은 배양 기간 후 플레이트에 계산 된 식민지를 기반으로하는 2 상자 살해 곡선 (그림 참조)입니다. 그러나이 방법은 예외적으로 느리기 때문에 임상 적 의사 결정을 적시에 방해합니다. 이 세포들의 본질을 이해하는 것은 우리가 그것들을 분리 할 수 없기 때문에 제한됩니다. 이 PHD 프로젝트는 고급 형광 이미징 및 세포 분류 기술을 통한 박테리아 지속성의 검출 및 이해에 혁명을 일으키는 것을 목표로합니다. 학생은 먼저 형광 이미징을 사용하여 비 성장 세포의 대사 상태를 매핑합니다. 다음으로, 지속성을위한 광학 프록시는 형광-활성화 세포 분류 (FACS)를 사용하여 페르사를 분리하기위한 프로토콜의 개발에 적용될 것이다. 이를 통해 페르 시터 표현형의 본질에 대한 통찰력을 얻을 수 있으며, 탐구 할 성장 재개를 억제하는 방법을 사용하여 궁극적으로 재발 감염을 예방하기위한 치료의 식별을 허용합니다.
이 프로젝트는 글로벌 건강에 중대한 영향을 미치는 최첨단 바카라사이트 온카판를 수행 할 수있는 독특한 기회를 제공합니다. 이 프로젝트에 참여하는 학생들은 박테리아 세포 배양의 기술 기술, 고급 형광 이미징 기술 및 데이터 분석, 형광 프로브를 사용하여 세포 대사 상태를 평가하는 능력 및 특정 세포 집단을 분리하기위한 FAC의 전문 지식을 포함하여 포괄적 인 학제 간 기술을 얻게됩니다. 학생은 박테리아 지속성과 항균성 저항 메커니즘에 대한 심층적 인 이해, 실험 설계, 데이터 해석 및 과학적 의사 소통에 대한 경험을 개발할 것입니다. McClelland 그룹의 초점은 실험적이고 정량적 미생물학이며, Blacker Group은 신진 대사를 조사하기위한 정량적 형광 기술을 개발합니다 [5]. 두 바카라사이트 온카판 팀의 일원으로서, 예비 학생은 UCL의 구조 및 분자 생물학과에 수용된 지적 다양하고 번성하는 바카라사이트 온카판 커뮤니티의 일원이 될 것입니다.
이 프로젝트는 물리 과학 졸업생이나 정량적 생물 학자에게 이상적이며 문제 해결을위한 요령이 있습니다. 우리는 미생물학, 생화학 및 실험적 바카라사이트 온카판에 뛰어 들기를 간절히 바라는 열정적 인 학생들을 환영합니다. 이러한 분야에서의 사전 경험이 필요하지 않습니다. 학습에 대한 열정과 변화를위한 추진력. 프로젝트에 대한 비공식적 인 토론을 보거나이 흥미로운 기회를 직접 신청하려면 Harry McClelland 또는 Thomas Blacker에 문의하십시오.
참조
[1] Naghavi, M. et al. 세균성 항균성 저항성의 글로벌 부담 1990–2021 : 2050 년까지의 체계적인 분석. Lancet S0140673624018671 (2024) DOI : 10.1016/S0140-6736 (24) 01867-1.
[2] Murray, C. J. L. et al. 2019 년 박테리아 항균성 저항의 글로벌 부담 : 체계적인 분석. Lancet 399, 629–655 (2022).
[3] Bigger, J. (1944). 간헐적 멸균에 의한 페니실린으로 포도상 감염의 치료. Lancet, 244, 497-500.
[4] Balaban, N. Q. et al. 항생제 지속성에 대한 바카라사이트 온카판를위한 정의 및 지침. Nat. Microbiol 목사. 17, 441–448 (2019).
[5] Blacker, T.S., Mann, Z.F., Gale, J.E., Ziegler, M., Bain, A. J., Szabadkai, G., & Duchen, M. R. (2014). FLIM을 사용하여 살아있는 세포 및 조직에서 NADH 및 NADPH 형광 분리. 자연 커뮤니케이션, 5 (1), 3936.